W przedłożonym sprawozdaniu Komisja Finansów Publicznych odniosła się do proponowanych przez rząd zmian polegających m.in. na wprowadzeniu procedury wiążących porozumień pomiędzy podatnikami (lub grupą powiązanych przedsiębiorstw) a administracją podatkową, zminimalizowaniu obowiązku osobistych kontaktów pomiędzy podatnikami a organami podatkowymi poprzez rozszerzenie form elektronicznych w kontaktach z podatnikami, wprowadzeniu rozwiązań, które w stosunku do toczących się postępowań i prawomocnych decyzji nakazywałyby uwzględniać skutki wynikające z procedury wzajemnego porozumiewania się w ramach umów o unikaniu podwójnego opodatkowania. Komisja odniosła się też w swoim sprawozdaniu do zmiany zaproponowanej przez Senat w zakresie odpowiedzialności odszkodowawczej za szkodę poniesioną na skutek wydania decyzji, która została następnie uchylona lub stwierdzono jej nieważność.
Warto też przypomnieć, że to właśnie przy okazji opisywanej nowelizacji Ordynacji podatkowej Komisja Finansów Publicznych przyjęła zmianę do ustawy o PIT oraz ustawy o CIT, której skutkiem miałby być obowiązek przekazywania darowizn na działalność charytatywno-opiekuńczą kościołów na ich rachunki bankowe. Obecnie przepisy ustaw kościelnych dające prawo do odliczania takich darowizn nie przewidują takiego wymogu.