Wcześniej wyrok w tej sprawie wydał Europejski Trybunał Sprawiedliwości. Spółkę Magoora reprezentowała w sporze kancelaria Baker & McKenzie. Sprawę prowadzili doradcy podatkowi Jerzy Martini i Zbigniew Liptak.
"W grudniu ubiegłego roku ETS wydał wyrok potwierdzający, że wprowadzenie przez Polskę z dniem akcesji do UE przepisów skutkujących rozszerzeniem zakresu ograniczeń dotyczących odliczenia VAT przy nabyciu paliwa, jak również późniejsza nowelizacja tych przepisów skutkująca rozszerzeniem zakresu tych ograniczeń w porównaniu ze stanem prawnym obowiązującym przed zmianą, naruszały prawo wspólnotowe (C-414/07). Po zapoznaniu się z treścią orzeczenia ETS i po przeprowadzeniu rozprawy w dniu 3 kwietnia br., WSA w Krakowie wydał powyższy wyrok. Z ustnego uzasadnienia wyroku wynika, że w ocenie WSA w Krakowie konsekwencje powyższej niezgodności w świetle konstytucyjnego porządku prawnego sięgają znacznie dalej, niż wynikałoby to z samego orzeczenia Trybunału. WSA wskazał, że ETS wykonuje swe kompetencje w zakresie określonym prawem wspólnotowym. Jednak w świetle zmian polskich przepisów o VAT oraz zmian przepisów homologacyjnych jedynym sposobem na uwzględnienie skutków potwierdzonego przez ETS naruszenia prawa wspólnotowego jest całkowite pominięcie ograniczeń prawa do odliczania VAT przy nabyciu paliwa wynikających z przepisów wprowadzonych w 2004 i 2005."
"3 kwietnia br. w podobnej sprawie zapadł również wyrok Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie. W tym przypadku sąd, uchylając negatywną dla podatnika interpretację indywidualną, ograniczył się jedynie do wskazania, że w świetle wyroku ETS w sprawie C-414/07 zakaz odliczania VAT od paliwa narusza prawo wspólnotowe w przypadkach, gdy jego zakres został rozszerzony w porównaniu z ograniczeniami rzeczywiście stosowanymi przed dniem przystąpienia Polski do UE." (źródło cytatów: informacja prasowa kancelarii Baker & McKenzie)
Pierwsze dwa wyroki WSA wskazują, że również w orzecznictwie sądowym nie ma jednolitego stanowiska, jak w praktyce powinno być stosowane orzeczenie ETS w sprawie Magoora C-414/07. Sąd w Krakowie zajął bardzo korzystne dla podatników stanowisko, że przy odliczeniu VAT od paliwa nie obowiązują ograniczenia wynikające z przepisów wprowadzonych w 2004 i 2005 r. Oznacza to, że obecnie obowiązujące w ustawie o VAT ograniczenia nie powinny być stosowane. Dlatego podatnik może odliczać VAT od paliwa do każdego samochodu, gdyż ograniczenia wynikające ze starej ustawy również nie obowiązują.
Jednak sąd w Warszawie zajął mniej korzystne stanowisko, z którego wynika, że ograniczeń w odliczeniu VAT nie stosujemy tylko wtedy, gdy powodują rozszerzenie ograniczeń, które obowiązywały przed przystąpieniem do UE.
oprac. Joanna Dmowska