Podatek tonażowy został wprowadzony do polskiego systemu podatkowego w 2006 r. Wprowadzenie możliwości wyboru podatku tonażowego miało zatrzymać zjawisko rejestrowania polskich statków pod obcymi banderami, miało też zwiększyć konkurencyjność polskich przedsiębiorstw żeglugowych. Podatek tonażowy jest podatkiem zryczałtowanym, którego wysokość zależy od pojemności netto statku i okresu jego eksploatacji, a nie od zysku z działalności - jak w przypadku podatku dochodowego.
W rozumieniu przepisów unijnych podatek tonażowy stanowi środek pomocy publicznej, dlatego wprowadzenie go wymagało akceptacji Komisji Europejskiej. W 2009 r. KE uznała, że jest on zgodny z wewnętrznym rynkiem UE, ale w ustawie z 2006 r., wprowadzającej podatek tonażowy, należy dokonać zmian.
Jak poinformowało Centrum Informacyjne Rządu, zaakceptowany 2 października przez rząd projekt noweli dostosowuje polskie prawo do decyzji KE z 2009 r.
"Określono, że przedsiębiorca żeglugowy, będący osobą fizyczną lub wspólnikiem spółki osobowej, nie będzie mógł odliczać od podatku tonażowego składek na ubezpieczenie zdrowotne oraz składek na ubezpieczenie społeczne od podstawy opodatkowania tym podatkiem" - czytamy w komunikacie CIR.
Ponadto, zgodnie z projektem, podatkiem tonażowym będzie można objąć holowniki i pogłębiarki - ale tylko w przypadku świadczenia przez nie usług transportu morskiego i zastosowania wobec nich odpowiedniego kryterium czasu pracy w danym roku podatkowym. Zaproponowano również, by przedsiębiorca, zarządzający cudzymi statkami z obszaru Unii Europejskiej, mógł korzystać z podatku tonażowego tylko wówczas, gdy wśród osób zatrudnionych na statkach i lądzie ponad połowa będzie obywatelami państw członkowskich UE.
"Nowe regulacje zakładają, że podatnik podatku tonażowego będzie korzystał z tej formy opodatkowania przez okres 10 lat - obecnie 5 lat. System podatku tonażowego ma obowiązywać od początku 2013 r. Jednocześnie, do końca 2013 r., zaplanowano okres przejściowy, czyli przewidziano prawo do opodatkowania podatkiem tonażowym na zasadach obecnie obowiązujących" - poinformował CIR.