Bezpieczny podpis elektroniczny jest rozwiązaniem, które może znaleźć zastosowanie nie tylko do wystawiania pojedynczych e-faktur, ale również, a może nawet przede wszystkim, do wystawiania e-faktur w sposób masowy.
Zgodnie z rozporządzeniem Rady Ministrów w sprawie określenia warunków technicznych..., dopuszczalne jest automatyczne i wielokrotne składanie bezpiecznego podpisu elektronicznego – podkreślono w stanowisku Krajowej Izby Rozliczeniowej, dotyczącym projektu rozporządzenia ministra finansów w sprawie sposobu i warunków wystawiania oraz przesyłania faktur w formie elektronicznej. Zdaniem Izby, udane powszechne wdrożenie bezpiecznego podpisu elektronicznego w ramach e-faktur znacznie ułatwi Ministerstwu Finansów i podatnikom stworzenie i sprawne uruchomienie całego systemu e-podatki.
