Podatnik, który sprzedawał towary opodatkowane w całości lub w części stawką niższą niż podstawowa, mógł wnioskować o rozszerzenie zwrotu VAT. W przypadku jednak, gdy organ podatkowy odmówił zwrotu, mógł jednocześnie zastosować sankcję, czyli dodatkowe zobowiązanie w VAT.
Takie stanowisko zajął Naczelny Sąd Administracyjny rozpoznając skargę kasacyjną spółki dotyczącą VAT za luty 2003 r. Spółka sprzedawała towary opodatkowane stawkami niższymi niż podstawowa. Za luty 2003 r. dokonała korekty deklaracji i złożyła wniosek o rozszerzenie zwrotu VAT. Organy podatkowe jednak zakwestionowały jej prawo do rozszerzonego zwrotu VAT. Jednocześnie zastosowały sankcję w postaci dodatkowego zobowiązania. Tym samym spółka nie tylko nie uzyskała zwrotu, ale – niejako na własne życzenie – została ukarana sankcją.
Spółka wniosła skargę do sądu administracyjnego, ale nie przyniosło to zamierzonego efektu. Sąd oddalił skargę przyznając organom podatkowym rację. Od wyroku przedstawiciele firmy wnieśli skargę kasacyjną. Podkreślali, że organy zastosowały sankcję w przypadku, gdy rozstrzygały na zasadzie uznania administracyjnego. Przeciwnego zdania były organy podatkowe. Wskazywały, że spółka składając wniosek nie spełniała warunków do uznania rozszerzonego zwrotu, o czym wiedziała. W ocenie organów, wystarczy samo wykazanie nienależnego zwrotu, żeby zastosować sankcję VAT.
Także NSA przyznał rację fiskusowi i oddalił skargę. Jak zauważył sąd, żaden przepis nie stanowi, że nieobowiązujący obecnie art. 21 ust. 5a ustawy z dnia 11 maja 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowym powoduje automatycznie niemożliwość zastosowania sankcji w postaci dodatkowego zobowiązania. Prowadziłoby to do sytuacji, w której wystarczyłoby, żeby podatnik wraz z błędnie wypełnioną deklaracją złożył wniosek o rozszerzony zwrot. Wówczas w każdej sytuacji chroniłby się przed dodatkowym zobowiązaniem. Skoro skarżąca miała świadomość tego, że nie spełnia warunków i domagała się rozszerzonego zwrotu VAT, to organy miały prawo zastosować wobec niej sankcje. Wyrok jest prawomocny. Sygn. akt FSK 2428/04.
